Файл ~/.netrc позволяет запоминать логин и пароль и создавать макросы для команды ftp:
machine ftp.freebsd.org login anonymous password edwin@mavetju.org machine myownmachine login myusername password mypassword macdef uploadtest cd /pub/tests bin put filename.tar.gz quit macdef dailyupload cd /pub/tests bin put daily-$1.tar.gz quit
Не забудьте сменить файлу права доступа, чтобы ваши пароли не подсмотрели посторонние:
$ chmod 0600 ~/.netrc
Подробнее о синтаксисе .netrc можно прочитать здесь.
Этот же файл для аутентификации понимает Net::FTP